汽化室內襯管在使用過程中，因為樣品的特殊屬性，造成硅烷化玻璃內襯管有殘留，會導致保留時間、面積的重復性變差時、檢測出鬼峰、儀器的基線波動，噪聲干擾等故障現象。
通常處理辦法：先合理取出內襯管，觀察玻璃襯管的形狀，如形狀異常時就無法進行正確的分析，觀察玻璃襯管的內壁是否污染，或有進樣墊碎渣，有些污染物是產生重復性誤差或產生鬼峰的原因、玻璃襯管的破損，破損是產生重復性差的原因、玻璃襯管內的石英棉，石英棉填裝不當是產生重復性差的原因。
備注：石墨壓環上附著溶劑是產生鬼峰的原因
玻璃襯管用溶劑清洗時請將石墨壓環卸下。清掉石英棉上附著的進樣墊渣 將石英棉用細棒捅出，裝入新的石英棉。清除附著在玻璃襯管內壁上的污垢 取出石英棉后，用蘸有溶劑的（丙酮等）的紗布等擦洗內壁。玻璃襯管內壁上的污垢嚴重部分浸于溶劑（丙酮等）中放置數小時。然后，用蘸溶劑的紗布等擦洗內壁。
汽化室內襯管的DMCS(二甲基氯硅烷化)處理:
現象：有些農藥樣品的峰重現性差，有偏差。吸附，分解，峰變小，含量不準。原因：進樣口的玻璃襯管或石英棉活性過高。產生吸附和分解。
處理辦法：1、玻璃襯管、石英棉用丙酮等溶劑清洗，晾干后在5%DMCS/n-正己烷中浸泡一夜。2、取出浸泡一夜的的玻璃襯管、石英棉，立即用甲醇清洗2-3次，然后再在甲醇中浸一小時左右。3、從甲醇中取出，晾干后與硅烷等一起在干燥條件下保存。